上传原始测序数据到NCBI

发表文章时对于数据的公开很多杂志做了强制性的要求，一来为了方便他人重复自己的结果，也为了更好整合和利用数据。我之前向NCBI上传过一批数据，没有记录具体的方法，后来也发现有不少人问起，刚好有一批新数据需要上传就顺便简单记录一下，有问题再详细写一下。

#1. 创建账号

#2. 创建Bioproject

关于具体内容，有什么就填什么，其中有一些必填项和选填项。

#3. 创建Biosample

同样是根据研究项目实际情况，填写信息；每填写完一步，都要点击页面下方的continue，保存已填写的信息。
填写表格时需注意尽量用不同属性区分不同样品。

4. 上传SRA

直接登录网址，创建 New submission。
https://submit.ncbi.nlm.nih.gov/subs/sra/
按照要求填写表格，如果数据量比较小，可以使用在线方式上传，对于数据量较大的项目，可以使用NCBI的Aspera软件，详细参见链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/submitfiles/
ascp -i <密码文件绝对路径> -QT -l100m -k1 -d <等待上传的文件绝对路径> subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/XXXXXXXXXXXX